Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod1Q60867 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms