Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms