Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sin3aQ60520 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms