Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms