Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scaf1Q5U4C3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf1Q5U4C3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms