Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl6Q5U3K5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms