Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyb5d2Q5SSH8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cyb5d2Q5SSH8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyb5d2Q5SSH8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms