Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms