Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trim41Q5NCC3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim41Q5NCC3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms