Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms