Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms