Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ecm2Q5FW85 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm2Q5FW85 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms