Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms