Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLK4

Zcchc6, Terminal uridylyltransferase 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc6Q5BLK4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zcchc6Q5BLK4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zcchc6Q5BLK4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms