Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spag9Q58A65 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spag9Q58A65 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms