Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpjQ569L8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms