Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms