Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca4bQ3UW98 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms