Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms