Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms