Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf223Q3UV31 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms