Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms