Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc4Q3UP24 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms