Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms