Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp30Q3UN04 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp30Q3UN04 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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