Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms