Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms