Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp19Q3UJD6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms