Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Greb1Q3UHK3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Greb1Q3UHK3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms