Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc174Q3U155 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms