Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms