Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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