Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms