Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms