Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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