Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Shroom4Q1W617 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shroom4Q1W617 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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