Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms