Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmntd2Q0VET5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms