Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms