Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms