Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms