Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kndc1Q0KK55 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms