Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttc21bQ0HA38 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms