Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms