Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms