Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms