Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms