Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprgQ05909 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms