Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Thbs3Q05895 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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