Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms